有機系濾膜比較疏水，但適用有機溶液。是疏水性微孔濾膜。有機系，用來過濾水溶液沒什么問題，但是反過來水系的則可能會被有機溶劑溶解，不適用于有機體系的過濾。要用途：濾除藥液、氣體、油類、飲料、酒類、電子儀表等的微粒的細菌，也可以作微粒、細菌的栓驗。
有機系濾膜的機理主要為截留作用。截留作用可以分為以下幾種：機械截留、吸附截留、架橋截留、在膜內部的網絡中截留。
1、機械截留：即篩分作用。指腹具有截留比其孔徑大或其孔徑相當的微粒等雜質的作用。
2、物理作用或吸附截留作用：除了考慮篩分作用，還要考慮其他因素的影響，其中包括吸附和電性能的影響。
3、架橋作用：在孔的入口處，微粒因為架橋作用也同樣可被截留。
4、網絡型膜的網絡截留作用。這種截留是將微粒截留在膜的內部，而不是膜的表面。
從上可見，篩分作用很重要，微粒等雜質與孔壁之間的相互作用有時較孔徑大小顯得更為重要。微孔過濾主要應用于分離大分子、膠體粒子、蛋白質以及其他微粒，他們的分離機理是根據分子或微粒的物理化學性能、所使用的膜的物理化學性能和他們之間的相互作用(如大小、形狀、電性能)不同而實現分離。
有機系濾膜進行微孔過濾的過程一般有三個階段：
1、初始階段：比膜孔徑大的粒子被截留在膜的表面，比膜小的粒子進入?？?，其中一些粒子由于各種力的作用被吸附在膜孔內，減少了膜孔的有效直徑；
2、過濾中期：微粒在膜表面開始形成濾餅層，膜孔內部吸附逐漸趨向于飽和；
3、后期階段：隨著更多微粒在膜表面被截留，膜孔內部吸附也趨于飽和，微粒開始堵塞膜孔，使膜通量趨于穩定繼而不斷的下降。
通過上述的3個過程，就能理解在溶出過程中濾膜吸附能達到飽和，隨著過濾次數的增加越來越難過濾。
